Pertama dilakukan adalah membuka project kita terus klik File > Add > New Project 

Pilih Other Project Types (sebelah kiri) > Setup and Deployment, terus pilih Setup Project (di sebelah kanan), lalu kita tentukan nama dan lokasi installer yang hendak kita buat.

Setelah selesai, maka kita akan masuk File System Setup, klik kanan Application Folder pilih Add > Project Output seperti tampilan di bawah ini.

Setelah selesai, maka kita klik kanan dari primary output yang dibuat di atas, klik kanan create shortcut to Primary Output. Lalu kita rename Project Output sesuai nama project yang kita kehendaki.

Setelah selesai, maka lihat di bagian kanan, project yang telah kita create, klik kanan terus pilih build.

Setelah selesai, cari installer yang baru kita buat tadi di lokasi, dan coba instalkan di komputer lain. Setelah install, untuk membuat shortcut di desktop, masuk ke drive C:/Program Files/Default Company Name/Nama Project > send ke desktop. Project installer exe kita sudah selesai di-create.

Note:
Create shortcut to primary output.. “, untuk membuat shortcut aplikasi setelah proses installasi

Sumber : http://alpz.wordpress.com/2011/03/11/membuat-installer-exe-windows-dengan-project-vb-net/